新型生物信息學工具將助力羅非魚養殖 |
2022-01-21 14:05:00 水產養殖網 出處:漁業博覽會
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| 一種新型基因組標記工具已被證明可以準確地識別羅非魚物種,并區分出雜交品種,為幫助非洲坦桑尼亞的水產養殖發展和強化保護提供了一種新的資源。
新工具提供了一種比全基因組測序數據分析更便宜的解決方案——全基因組測序數據分析是目前監測當地生物多樣性的主要方法。
這項新工具由厄勒姆學院、坦桑尼亞漁業研究所、羅漢普頓大學、班戈大學、布里斯托爾大學和英國東安格利亞大學共同牽頭研究,能夠識別羅非魚物種,并精確定位入侵羅非魚和本地羅非魚之間的雜交進化后的變異品種。
近幾十年來,熱帶內陸水產養殖產量迅速增長,2018年達到4700萬噸。羅非魚是一種以口孵非鯽屬為主的麗魚科魚類,原產于非洲和中東,其構成熱帶內陸水產養殖擴張的關鍵部分——占全球總量的550萬噸。由于氣候變化和人口增長給非洲國家脆弱的糧食安全體系帶來更大的壓力,因此內陸水產養殖的持續擴張在當地尤為重要。
由于氣候變化導致內陸水域溫度逐漸升高,其帶來的物理與化學變化讓非洲漁業受到影響。加上撒哈拉以南的非洲和亞洲地區人口預計在2100年增至90億,人們也更加關注糧食安全問題。
羅非魚是非洲本地物種,包括坦桑尼亞在內的東非是羅非魚物種自然多樣性的熱點地區。在坦桑尼亞已發現8種完全特有的口孵非鯽屬物種,此外還有12種是與鄰國共享流域特有的物種。其中一些物種適應了獨特的環境條件,如高溫、鹽度和pH值,對未來水產養殖發展有利。
研究報告專家認為羅非魚品種區分主要依賴型態特征,此種方式對水產養殖造成了一定困難,目前已經開發出的基于96個單核苷酸多態性(SNPs)生物標志的優化設計可以幫助提升鑒定的準確性。由于羅非魚是水產養殖中一種非常重要的魚類,養殖品種作為非本土物種被引入許多水體,這在本地羅非魚物種容易雜交的地區造成了一些問題。雜交羅非魚的生存狀況較差,生長速度較慢,既威脅自然種群的生存,也威脅到羅非魚養殖場的生存。如果養殖場誤把雜交物種當作純物種養殖,那么可能會導致養殖場倒閉。
目前外來水產養殖物種已經在野外威脅到坦桑尼亞本地物種,本地物種的特征還很不明顯,鑒定純種種群將利于本地物種保護。對養殖物種野生近親的保護也將有利于保護獨特的遺傳資源。
專家還表示,新的檢測標記方式為評估漁業孵化場的種苗純度提供了重要的資源,有助于保護獨特的地方生物多樣性。他們希望這種更便宜和便捷的工具能用于評估養殖場種群,并為調查自然水體中羅非魚雜交情況提供依據。 |
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