在芽孢桿菌的使用上，許多人就會發出這樣的疑問，為什么包裝袋上同是芽孢桿菌，為什么一些廠家的一公斤有效用量1-2畝水體，而有的廠家的芽孢原粉推薦使用一公斤用到20畝水體。特別是一些第一次使用芽孢原粉的客戶，我們總要反復解釋。尤其是當問到一公斤多少錢時，許多人就會說別的廠家多少多少，然后我們只好反問到，那一公斤能用多少畝有效呢，再問一畝折合多少成本呢？這時基本都會得到一畝三四塊以上的成本，有的可能還會更高。
當然對比，一定是在同等效果的情況下對比。所以說到同等效果，這里就不得不說到的一些簡單判斷方法。如水桶法，取兩個同樣大小的白色塑料桶，在料臺采同樣位的池塘水，根據水體多少去計算用量，進行對比。也可放置相同的用量，對比分解有機質的多少。也可以采樣同樣大小的魚塘，施入相應的劑量，以此來對比效果。而且用量均按廠家推薦用量對比，然后通過水色、透明度，顯微鏡鏡檢藻類多少等方法加以對比。
當然最為準確科學的辦法，就是送檢相關的權威機構，進行菌數含量的測定，如中國最具權威的國家微生物試驗室。之前，我們曾做過一些試驗，當活菌含量在10-20億每克時，按1公斤每畝的用量使用，就能明顯的分解水體中的有機質，如果菌數含量增加到200億時，就只需要50克就能達到明顯的分解水體中有機質的效果。除此之外，就是載體的差異，有全溶的，也有用沸石粉做載體的，也有用淀粉做載體的，假如一公斤菌中，其中菌種是50克，那么其余的950克就都是載體，這也就是為什么有的一公斤只能用1-2畝水體，而單用50克菌種也可以用1畝水體的原故。
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